中药鉴定常用的鉴定方法有：来源（原植物、动物和矿物）鉴定法、性状鉴定法、显微鉴定法及理化鉴定法以及近年发展起来的生物鉴定法和指纹图谱鉴定法等。
一、来源鉴定法
　　来源鉴定法又称基原鉴定法，是应用植（动、矿）物的分类学知识，对中药的来源进行鉴定，确定其正确的学名，以保证中药的品种准确无误。来源鉴定的内容包括：植（动）物药的原植（动）物科名、植（动）物名、拉丁学名、药用部位，矿物药的类、族、矿石名或岩石名。以原植物鉴定为例，其步骤如下。
1、观察植物形态
　　对具有较完整植物体的检品，应注意观察根、茎、叶、花和果实等部位的特征，对繁殖器官（花、果或孢子囊、子实体等）尤应仔细观察，并做好记录。
2、核对文献
3、核对标本
　　当初步鉴定出检品是什么科、属、种时，可以到相关标本馆与已正确鉴定学名的该种标本核对。如有条件，能与模式标本（发表新种时所被描述的植物标本）核对，或请有关专家、植物分类研究单位协助鉴定，可获得正确鉴定结果。
二、性状鉴定法
　　性状鉴定法就是用眼观、手摸、鼻闻、口尝、水试、火试等十分简便的方法来鉴别药材的外观性状，这些方法在我国医药学宝库中积累了丰富的传统鉴别经验，它具有简单、易行、迅速的特点。
　　性状鉴定与来源鉴定一样，除仔细观察样品外，有时亦需与标准药材标本和文献核对，有的药材还要注意栽培品与野生品的差异。
　　性状鉴定的内容包括：形状、大小、色泽、表面特征、质地、断面特征、气、味、水试、火试等。
  1、形状：是指药材的形态。药材的形状与药用部位有关。每种药材的形状一般比较固定。有的经验鉴别术语形象生动，好懂易记，如党参根头部分称为“狮子头”，款冬花形如“火炬头”，海马外形为“马头蛇尾瓦楞身”等。
  2、大小：是指药材的长短、粗细（直径）和厚度。
  3、色泽：是指在自然光下观察药材的颜色及光泽度。药材的颜色与其成分有关，每种药材常有自己特定的颜色，如丹参色红、黄连色黄、紫草色紫、熟地黄色黑等。颜色是否符合要求，是衡量药材质量好坏的重要标准之一。通常大部分药材的颜色不是单一而是复合的，如用两种色调复合描述色泽时，以后一种色调为主色，例如黄棕色，即以棕色为主色，而棕黄色，则以黄色为主色。
  4、表面特征：指药材表面是光滑还是粗糙，有无皱纹、皮孔、鳞片、毛茸或其他附属物及有无节等。如白芥子表面光滑，紫苏子表面有网状纹理，海桐皮表面有钉刺，合欢皮的皮孔棕红色、椭圆形，辛夷（望春花）苞片外表面密被灰白色或灰绿色有光泽的长茸毛，均为其重要鉴别特征。叶类药材包括上表面和下表面，皮类药材的表面特征包括外表面和内表面特征。
 5、质地：药材的轻重、软硬、坚韧、疏松（或松泡）、致密、黏性、粉性、油润、角质、绵性、柴性等特征。有的药材因加工方法不同，质地也不一样，经蒸、煮加工的药材，常质地坚实，半透明，呈角质样；富含淀粉者，晒干后质地常显粉性。
  6、断面特征：包括自然折断面和横切面。折断面特征指药材折断时的现象，如是否容易折断，有无声响，有无粉尘散落及折断时断面上的特征；断面是否平坦，或显纤维性、颗粒性、裂片状，有无胶丝，是否可以层层剥离，有无放射状纹理等。对不易折断或折断面不平坦的药材，可削平后观察维管束排列情况、射线的分布等。横切面的经验鉴别术语很多，如“菊花心”，是指药材横切面上维管束与不甚直的射线排列成细密的放射状纹理，且在皮部沿射线常有裂隙，形如开放的菊花，如黄芪、甘草等；“车轮纹”是指药材横切面上维管束与较宽而直的射线排列成稀疏整齐的放射状纹理，形如木质车辐，如防己等；茅苍术有“朱砂点”等；还有一些属于异常构造的，如大黄的“星点”，何首乌的“云锦状花纹”，商陆的“罗盘纹"等。横切面的特征在鉴别药材及饮片时特别有意义。
  7、气：有些药材有特殊的香气或臭气，如阿魏具强烈的蒜样臭气，檀香、麝香有特异芳香气，白鲜皮有羊膻气等，这是由于这些药材含有挥发性物质的缘故，也是药材的重要鉴别特征之一。
  8、味：药材的味感是由其所含的化学成分决定的，每种药材的味感是比较固定的，对鉴别某些药材的真伪甚至质量的鉴别特别有价值，如乌梅、木瓜均以味酸为好；黄连、黄柏以味越苦越好；甘草、党参以味甜为好等。检查味感时，可取少量有代表性的药材在口里咀嚼约1分钟，使舌面的各部位都接触到药液，或用开水浸泡后尝浸出液。有毒的药材如川乌、草乌、半夏、白附子等需尝味时，取样要少，尝后应立即吐出漱口，洗手，以免中毒。
  9、水试：利用某些药材在水中产生的各种特殊的变化来鉴别药材，如沉浮、溶解情况、颜色、透明度、有无黏性、膨胀度、旋转与否及有无荧光等。如红花加水浸泡后，水液染成金黄色，药材不变色；秦皮水浸，浸出液在日光下显碧蓝色荧光；苏木投热水中，水显鲜艳的桃红色；来源于旌节花属植物的小通草遇水表面显黏性；熊胆粉末投入清水杯中，即在水面旋转并呈黄色线状下沉而短时间内不扩散；哈蟆油用温水浸泡，膨胀系数不低于55等，这些现象常与药材中所含有的化学成分或组织构造密切相关。
  10、火试：有的药材用火烧之，能产生特殊的香气或臭气，会有颜色、烟雾、闪光或响声等现象出现，可据此鉴别其真伪甚至优劣。如麝香少许用火烧时有轻微的爆鸣声，起油点似珠，浓香四溢，灰烬白色；海金沙易点燃并产生爆鸣声及闪光，而松花粉及蒲黄无此现象，可资鉴别。

三、显微鉴定法
　　显微鉴定法是利用显微技术对中药进行显微分析，以确定其品种和质量的一种鉴定方法。
　　显微鉴定主要包括组织鉴定和粉末鉴定，通过显微镜观察药材的组织构造、细胞形状及内含物的特征、矿物的光学特性和用显微化学方法确定细胞壁及细胞内含物的性质或某些品种有效成分在组织中的分布等，用以鉴别药材的真伪与纯度甚至品质，以及对中成药是否按处方规定投料进行鉴定。
（一）显微制片方法
 1、横切面或纵切面制片
 2、表面制片
 3、粉末制片
 4、解离组织片
　　对一些富含纤维、石细胞、导管、管胞，细胞彼此不易分离的组织，常需使用化学试剂溶解细胞之间的胞间层，使细胞离散，以便观察细胞的完整形态。
　　如供试品中薄壁组织占大部分，木化组织少或分散存在，可用氢氧化钾法；如果供试品质地坚硬，木化组织较多或集成较大群束，可用硝铬酸法或氯酸钾法。
 5、磨片制片
　　坚硬的矿物药、动物药，可采用磨片法制片
 6、含饮片粉末的中成药显微制片
（二）植物细胞壁和细胞后含物性质的鉴别
  1、细胞壁性质的鉴别
　　（1）木质化细胞壁 加间苯三酚试液1～2滴，稍放置，加盐酸1滴，因木化程度不同，显红色或紫红色。
　　（2）木栓化或角质化细胞壁 加苏丹Ⅲ试液，稍放置或微热，显橘红色至红色。
　　（3）纤维素细胞壁 加氯化锌碘试液，或先加碘试液湿润后，稍放置，再加硫酸溶液（33→50），显蓝色或紫色。
　　（4）硅质化细胞壁 加硫酸无变化。
 2、细胞后含物性质的鉴别
　　（1）淀粉粒　①加碘试液，显蓝色或紫色。②用甘油醋酸试液装片，置偏光显微镜下观察，未糊化的淀粉粒显偏光现象；已糊化的无偏光现象。
　　（2）糊粉粒　①加碘试液，显棕色或黄棕色。②加硝酸汞试液，显砖红色。材料中如含有多量脂肪油，宜先用乙醚或石油醚脱脂后进行试验。
　　（3）脂肪油、挥发油或树脂　①加苏丹Ⅲ试液，显橘红色、红色或紫红色。②加90%乙醇，脂肪油和树脂不溶解（蓖麻油及巴豆油例外），挥发油则溶解。
　　（4）菊糖 加10%α-萘酚乙醇溶液，再加硫酸，显紫红色并很快溶解。
　　（5）黏液　加钌红试液，显红色。
　　（6）草酸钙结晶　①加稀醋酸不溶解，加稀盐酸溶解而无气泡发生。②加硫酸溶液（1→2），逐渐溶解，片刻后析出针状硫酸钙结晶。
　　（7）碳酸钙结晶（钟乳体）　加稀盐酸溶解，同时有气泡发生。
　　（8）硅质　加硫酸不溶解。
（三）显微临时制片常用封藏试液
  1、蒸馏水、稀甘油：适用于观察淀粉粒、油滴、树脂等细胞后含物及细胞壁的颜色。经水合氯醛透化的切片或粉末，加稀甘油1滴，可防止水合氯醛析出结晶，并使切片透明。
　 2、甘油醋酸试液：为常用封藏剂，使淀粉粒不膨胀变性，特别适宜淀粉粒的观察与显微测量。
　 3、水合氯醛试液：为最常用的透化剂。切片或中药粉末加水合氯醛液并适当加热处理，可使皱缩的细胞膨胀，并可溶解多种色素，如叶绿素等以及树脂、淀粉粒、蛋白质、菊糖、挥发油，而各种晶体不溶解。有清洁、透明作用，使细胞、组织透明、清晰，便于观察细胞形状和组织构造及细胞内含的各种结晶体。

四、理化鉴定法

　　理化鉴定法就是利用某些物理的、化学的或仪器分析方法，鉴定中药的真实性、安全性和品质优劣程度的方法，统称为理化鉴定法。常用的理化鉴定方法如下。
（一）物理常数的测定
　　包括相对密度、旋光度、折光率、硬度、黏稠度、沸点、凝固点、熔点等的测定。这对挥发油类、油脂类、树脂类、液体类药（如蜂蜜等）和加工品类（如阿胶等）药材的真实性和纯度的鉴定具有特别重要的意义。药材中如掺有其他物质时，物理常数就会随之改变，如《中国药典》2010年版规定蜂蜜的相对密度在1.349以上，蜂蜜中掺水就会影响黏稠度，使相对密度降低。
（二）一般理化鉴别
 1、中药的膨胀度
　　膨胀度是药品膨胀性质的指标，系指按干燥品计算，每1ｇ药品在水或者其他规定的溶剂中，在一定时间与温度条件下膨胀所占有的体积（ml）。主要用于含黏液质、胶质和半纤维素类中药的真伪和质量控制。
　　南葶苈子和北葶苈子外形不易区分，北葶苈子膨胀度不低于12，南葶苈子膨胀度不低于3，两者的膨胀度差别较大，通过测定比较可以区别二者。又如哈蟆油膨胀度不得低于55，伪品的膨胀度远低于此，可资区别。膨胀度同时也是对中药质量优良度的一种评判方法，如哈蟆油和车前子正品一般膨胀度越大，其质量越好。
 2、微量升华
　　是利用中药中所含的某些化学成分，在一定温度下能升华的性质，获得升华物，在显微镜下观察其结晶形状、色泽，或取升华物加某种试液观察其反应来进行鉴别。如大黄粉末升华物为黄色针状、片状或羽毛状结晶，在结晶上加碱试液显红色，确证其为蒽醌类化合物；斑蝥升华物（在30～140℃）为白色柱状或小片状结晶（斑蝥素），加碱液溶解，再加酸液又析出结晶等。
 3、荧光分析
　　是利甩中药中所含的某些化学成分，在紫外光或常光下能产生一定颜色的荧光的性质进行鉴别。除另有规定外，紫外光灯的波长为365nm，如用短波（254～265 nm）时，应加以说明。如黄连折断面在紫外光灯下显金黄色荧光，木质部尤为明显；秦皮的水浸出液在自然光下显碧蓝色荧光。有些中药本身不产生荧光，但用酸、碱或其他化学方法处理后，可使某些成分在紫外光灯下产生可见荧光，例如芦荟水溶液与硼砂共热，即起反应显黄绿色荧光。
（三）色谱法
　　色谱法根据分离方法分为：纸色谱法、薄层色谱法、柱色谱法、气相色谱法、高效液相色谱法、电泳色谱法等。
 1、薄层色谱法
　　《中国药典》规定除设化学对照品外，同时还设对照药材作对照，如黄连、黄柏、人参等。
　　薄层色谱法因其快速、简便和灵敏，是目前中药鉴定中用于定性鉴别使用最多的色谱法之一。
 2、高效液相色谱法
　　高效液相色谱法具有分离效能高、分离速度快、灵敏度和准确度高、重现性好、专属性强等特点，因该法不受样品挥发性的约束，对低挥发性、热稳定性差、高分子化合物和离子型化合物均较适合，高效液相色谱既可用于定性鉴别又可用于定量分析，现已成为中药含量测定方法的首选和主流。
 3、气相色谱法
　　气相色谱法最适用于含挥发油及其他挥发性成分的药材及中成药的分析，用于药品的鉴别、杂质检查、水分测定、农药残留量测定和含量测定。
4.电泳色谱法
　　动物类、果实种子类及根茎类等含蛋白质及氨基酸类成分的药材，已用该法成功地进行真伪鉴别。

（四）分光光度法
　　分光光度法包括紫外-可见分光光度法、红外分光光度法和原子吸收分光光度法。
 1、紫外-可见分光光度法
　　本法具有灵敏、简便、准确，既可作定性分析又可作含量测定等优点，适用于大类成分的含量测定，如总黄酮、总生物碱、总蒽醌等。
 2、红外分光光度法
 3、原子吸收分光光度法
　　本法的特点为专属性强，检测灵敏度和精度均高，测定速度快，、是目前用于测定中药中重金属及有害元素、微量元素最常用的方法，《中国药典》2010年版一部就采用本法进行重金属及有害元素限量检查。