现代生物技术

夏九成

目录

  • 1 一 单元 绪论
    • 1.1 课件
  • 2 二单元 基因工程
    • 2.1 课件
  • 3 三单元 蛋白质工程
    • 3.1 课件
  • 4 四单元 细胞工程
    • 4.1 课件
  • 5 五单元,发酵工程
    • 5.1 课件
  • 6 六单元,酶工程
    • 6.1 课件
  • 7 七单元,现代生物技术的应用
    • 7.1 课件
  • 8 生物技术的创新与风险
    • 8.1 课件
  • 9 绪论
    • 9.1 课程整合的设置
    • 9.2 教学理念
    • 9.3 PBL
  • 10 蛋白质的结构和功能
    • 10.1 前置问题及学习目标
    • 10.2 蛋白质的分子组成
    • 10.3 蛋白质的分子结构
    • 10.4 蛋白质结构与功能的关系
    • 10.5 蛋白质的理化性质及应用
    • 10.6 必交作业
    • 10.7 氨基酸是蛋白质的基本组成单位
    • 10.8 氨基酸的基本结构
    • 10.9 氨基酸的分类
    • 10.10 氨基酸的理化性质
    • 10.11 蛋白质是氨基酸通过肽键相连而成的生物大分子
    • 10.12 氨基酸的排列顺序是蛋白质的一级结构
    • 10.13 多肽链主链的局部空间构象是蛋白质的二级结构
    • 10.14 肽单元
    • 10.15 主要二级结构形式
    • 10.16 超二级结构-模体
    • 10.17 侧链R基团的相互作用形成蛋白质的三级结构
    • 10.18 亚基缔合成分子—蛋白质的四级结构
    • 10.19 蛋白质一级结构是空间构象和功能的基础
    • 10.20 蛋白质的功能依赖其特定的空间构象
    • 10.21 蛋白质具有和氨基酸相同的和自身特殊的理化性质
    • 10.22 利用蛋白质的性质分离纯化蛋白质
  • 11 核酸的结构与功能
    • 11.1 前置问题及学习目标
    • 11.2 核酸的化学组成和一级结构
    • 11.3 DNA的结构和功能
    • 11.4 RNA的结构与功能
    • 11.5 核酸的理化性质
    • 11.6 必交作业
    • 11.7 核酸分类及基本组成单位—核苷酸
    • 11.8 核酸的一级结构是核苷酸的排列顺序
    • 11.9 DNA的二级结构是双螺旋结构
    • 11.10 DNA的三级结构是超螺旋结构
    • 11.11 mRNA从DNA转录遗传信息指导蛋白质合成
    • 11.12 tRNA是蛋白质合成的接合器分子
    • 11.13 rRNA参与蛋白质的合成场所-核糖体的组成
    • 11.14 细胞内其它小分子RNA参与体内重要过程
    • 11.15 核酸的酸性和紫外吸收特性
    • 11.16 核酸的变性和分子杂交技术
  • 12 酶与辅酶
    • 12.1 前置问题及学习目标
    • 12.2 酶的分子结构
    • 12.3 酶的分类与命名
    • 12.4 酶的反应特点与机制
    • 12.5 酶促反应的动力学
    • 12.6 酶活性的调节
    • 12.7 必交作业
    • 12.8 酶的分子组成
    • 12.9 酶的空间结构
    • 12.10 酶促反应的特点
    • 12.11 酶促反应的机制
    • 12.12 底物浓度对反应速度的影响
    • 12.13 酶浓度对反应速度的影响
    • 12.14 温度对反应速度的影响
    • 12.15 pH对反应速度的影响
    • 12.16 抑制剂对反应速度的影响
    • 12.17 激活剂对酶促反应速度的影响
    • 12.18 酶原与酶原激活
    • 12.19 酶的变构调节
    • 12.20 酶的共价修饰调节
    • 12.21 细胞外基质
    • 12.22 酶含量的调节
    • 12.23 同工酶
  • 13 糖复合物
    • 13.1 前置问题及学习目标
    • 13.2 糖蛋白
    • 13.3 蛋白聚糖
    • 13.4 糖脂
    • 13.5 糖蛋白的结构
    • 13.6 糖蛋白的功能
    • 13.7 蛋白聚糖的结构
    • 13.8 蛋白聚糖的功能
  • 14 糖代谢
    • 14.1 前置问题及学习目标
    • 14.2 代谢概述
    • 14.3 糖代谢
    • 14.4 必交作业
    • 14.5 糖代谢概述
    • 14.6 糖的生理功能
    • 14.7 糖的消化
    • 14.8 糖的吸收
    • 14.9 糖的转运
    • 14.10 糖的无氧酵解
    • 14.11 糖酵解途径
    • 14.12 乳酸生成
    • 14.13 糖酵解能量生成
    • 14.14 糖酵解的调节
    • 14.15 糖酵解的生理意义和临床联系
    • 14.16 如何学习代谢?
    • 14.17 糖的有氧氧化
    • 14.18 反应过程-丙酮酸氧化
    • 14.19 反应过程-柠檬酸循环1
    • 14.20 柠檬酸循环2--三羧酸循环总结
    • 14.21 柠檬酸循环3--有氧氧化的调节
    • 14.22 糖有氧氧化的生理意义
    • 14.23 糖酵解与有氧氧化的协调
    • 14.24 磷酸戊糖途径
    • 14.25 磷酸戊糖途径反应过程
    • 14.26 磷酸戊糖途径生理意义
    • 14.27 糖醛酸代谢
    • 14.28 糖异生
    • 14.29 糖异生代谢途径
    • 14.30 糖异生原料
    • 14.31 糖异生调节
    • 14.32 糖异生生理意义
    • 14.33 糖原合成与分解
    • 14.34 反应过程、分支酶作用及合成起始
    • 14.35 反应过程及脱枝酶
    • 14.36 变构、化学修饰和临床的相关性
    • 14.37 血糖与血糖调节
  • 15 生物氧化
    • 15.1 前置问题及学习目标
    • 15.2 生物氧化的概述
    • 15.3 线粒体氧化体系
    • 15.4 其它氧化体系
    • 15.5 必交作业
    • 15.6 呼吸链
    • 15.7 呼吸链的组成成分
    • 15.8 呼吸链的排列次序
    • 15.9 氧化磷酸化
    • 15.10 氧化磷酸化的偶联数目与偶联部位
    • 15.11 氧化磷酸化的偶联机制
    • 15.12 ATP合酶
    • 15.13 氧化磷酸化的影响因素
    • 15.14 ATP的转运与储存
    • 15.15 胞液NADH的氧化
  • 16 脂类代谢
    • 16.1 前置问题及学习目标
    • 16.2 脂类概述
    • 16.3 脂肪的分解代谢
    • 16.4 脂肪的合成代谢
    • 16.5 磷脂的代谢
    • 16.6 胆固醇代谢
    • 16.7 血浆脂蛋白代谢
    • 16.8 必交作业
    • 16.9 脂类的一般概念
    • 16.10 脂类的分布与生理功能
    • 16.11 脂类的消化和吸收
    • 16.12 脂肪动员与激素敏感脂肪酶
    • 16.13 脂肪酸的氧化分解
    • 16.14 酮体的生成与利用
    • 16.15 甘油的氧化分解
    • 16.16 脂肪酸的合成部位与原料
    • 16.17 丙二酰CoA的合成
    • 16.18 软脂酸的合成
    • 16.19 脂肪酸链的延长
    • 16.20 不饱和脂肪酸的合成
    • 16.21 多不饱和脂肪酸的衍生物
    • 16.22 3-磷酸甘油的合成
    • 16.23 脂肪的合成
    • 16.24 磷脂的分类、结构与功能
    • 16.25 甘油磷脂的代谢
    • 16.26 鞘磷脂的代谢
    • 16.27 胆固醇的合成
    • 16.28 胆固醇在体内的转变与排泄
    • 16.29 血脂
    • 16.30 血浆脂蛋白的分类、组成及结构
    • 16.31 血浆脂蛋白代谢
  • 17 氨基酸代谢
    • 17.1 前置问题及学习目标
    • 17.2 氨基酸的生理功能与营养价值
    • 17.3 体内氨基酸的来源
    • 17.4 氨基酸的分解代谢
    • 17.5 氨基酸的分类代谢
    • 17.6 必交作业
    • 17.7 蛋白质的消化、吸收和腐败
    • 17.8 体内氨基酸的降解
    • 17.9 非必需氨基酸的合成
    • 17.10 氨基酸代谢池
    • 17.11 氨基酸的脱氨基作用
    • 17.12 转氨基作用
    • 17.13 氧化脱氨
    • 17.14 联合脱氨
    • 17.15 其他脱氨方式
    • 17.16 氨的代谢
    • 17.17 氨的来源与去路
    • 17.18 氨的转运
    • 17.19 尿素的合成
    • 17.20 α-酮酸的代谢
    • 17.21 氨基酸的脱羧基作用
    • 17.22 一碳单位的代谢
    • 17.23 含硫氨基酸的代谢
    • 17.24 肌酸的代谢
    • 17.25 芳香族氨基酸的代谢
    • 17.26 支链氨基酸的代谢
  • 18 核苷酸代谢
    • 18.1 前置问题及学习目标
    • 18.2 嘌呤核苷酸代谢
    • 18.3 嘧啶核苷酸代谢
    • 18.4 脱氧核糖核苷酸的合成
    • 18.5 嘌呤核苷酸的合成代谢
    • 18.6 嘌呤核苷酸的从头合成途径
    • 18.7 嘌呤核苷酸的补救合成途径
    • 18.8 嘌呤核苷酸的分解代谢
    • 18.9 核苷酸的抗代谢物
  • 19 血液生化
    • 19.1 前置问题及学习目标
    • 19.2 血液化学成分
    • 19.3 红细胞代谢
    • 19.4 血红素合成原料
    • 19.5 铁卟啉结构和血红素生物合成
    • 19.6 铁的来源
    • 19.7 成熟RBC的代谢通路
    • 19.8 糖酵解
    • 19.9 2,3-BPG支路
    • 19.10 磷酸戊糖途径
  • 20 与肝胆生化
    • 20.1 前置问题及学习目标
    • 20.2 肝脏解剖及生化功能
    • 20.3 生物转化
    • 20.4 胆汁及胆汁酸代谢
    • 20.5 胆色素代谢及黄疸
    • 20.6 解剖特点
    • 20.7 肝脏物质代谢中心
    • 20.8 糖代谢
    • 20.9 肝脏的脂代谢
    • 20.10 肝脏的蛋白质代谢
    • 20.11 肝脏的维生素代谢
    • 20.12 肝脏的激素代谢
    • 20.13 概念、意义
    • 20.14 生物转化反应
    • 20.15 第一相反应
    • 20.16 第二相反应
    • 20.17 生物转化特点
    • 20.18 影响生物转化的因素
    • 20.19 胆汁概述
    • 20.20 胆汁酸分类
    • 20.21 胆汁酸代谢及肠肝循环
    • 20.22 胆红素的合成
    • 20.23 胆红素在血液中的运输
    • 20.24 胆红素在肝细胞摄取和转化
    • 20.25 胆红素在肠道排出
    • 20.26 胆红素和黄疸
  • 21 DNA的生物合成
    • 21.1 前置问题及学习目标
    • 21.2 DNA复制—导言
    • 21.3 DNA复制原则
    • 21.4 DNA复制过程所需酶
    • 21.5 DNA复制过程起始,延长和终止
    • 21.6 逆转录
    • 21.7 DNA损伤与修复--损伤
    • 21.8 DNA损伤与修复--修复
    • 21.9 必交作业
    • 21.10 半保留复制
    • 21.11 双向复制
    • 21.12 半不连续复制
    • 21.13 解螺旋酶
    • 21.14 拓扑异构酶
    • 21.15 单链DNA结合蛋白
    • 21.16 引物酶
    • 21.17 聚合酶
    • 21.18 连接酶
  • 22 RNA的生物合成
    • 22.1 前置问题及学习目标
    • 22.2 概述
    • 22.3 RNA 转录体系
    • 22.4 RNA 生物合成过程
    • 22.5 RNA 转录后加工
    • 22.6 RNA 复制
    • 22.7 必交作业
    • 22.8 RNA聚合酶
    • 22.9 DNA 转录模板
    • 22.10 真核和原核的启动子特点和功能
    • 22.11 终止子和增强子
    • 22.12 原核生物RNA转录
    • 22.13 真核生物RNA转录
    • 22.14 原核细胞RNA转录后加工
    • 22.15 真核细胞RNA转录后加工
    • 22.16 rRNA和tRNA的转录后加工
    • 22.17 mRNA的转录后加工
  • 23 蛋白质的翻译
    • 23.1 前置问题及学习目标
    • 23.2 概述
    • 23.3 蛋白质生物合成体系
    • 23.4 蛋白质生物合成过程
    • 23.5 蛋白质生物合成后加工(PTM)
    • 23.6 蛋白质翻译的抑制
    • 23.7 必交作业
    • 23.8 遗传密码载体-mRNA
    • 23.9 氨基酸载体—tRNA/adaptor
    • 23.10 蛋白质合成场所: 核糖体(Ribosomes)
    • 23.11 氨基酸的活化
    • 23.12 翻译的起始
    • 23.13 翻译的延长
    • 23.14 翻译的终止
    • 23.15 总结蛋白质生物合成过程
    • 23.16 真核生物蛋白质生物合成的主要区别
    • 23.17 总结参与蛋白质翻译合成的因子
    • 23.18 理解遗传信息传递在科研的应用
    • 23.19 一级结构加工
    • 23.20 高级结构加工
    • 23.21 蛋白质折叠异常所导致的疾病
    • 23.22 蛋白质的靶向输送(protein targeting)
    • 23.23 抗生素类
    • 23.24 干扰蛋白质生物合成的活性物质
糖酵解途径


一、糖酵解途径

1930 年代,Embden 和 Meyerhof 等德国化学家阐明了糖酵解途径

Embden-Meyerhof 途径:葡萄糖到丙酮酸的途径

1941 年,Lipmann 和 Kalckar 发现 ATP 的作用

     


糖酵解的概况

糖酵解的两个阶段:耗能阶段和产能阶段

耗能阶段(preparatory phase):

 · 消耗两分子 ATP,活化葡萄糖

 · 六碳糖裂解为三碳糖

产能阶段(payoff phase):

 · 三碳糖转变为丙酮酸

 · 生成四分子 ATP 和两分子 NADH


1. 葡萄糖的磷酸化(phosphorylation)

葡萄糖(glucose)己糖激酶(hexokinase)作用,转变为 6-磷酸葡萄糖 (glucose-6-phosphate,G-6-P)

葡萄糖的磷酸化是葡萄糖所有代谢方式的共有途径


反应特点与意义

反应是放能的,生理条件下不可逆

 · ATP 提供磷酸基,以Mg+-ATP形式参与

 · Mg是HK必须激活剂

 · G6P是HK反馈抑制物

反应的意义:

 · 磷酸化可以激活葡萄糖,有利于进一步代谢

 · 葡萄糖的磷酸化形式不能通过细胞膜,可防止葡萄糖自细胞流失

 · 糖酵解的所有中间产物均以磷酸化形式存在


己糖激酶(HK)与葡萄糖激酶(GK)

己糖激酶(hexokinase)有 4 种同工酶

I-III 型:

· 底物特异性不强,可催化葡萄糖、甘露糖、果糖等的磷酸化

· 分布于几乎所有的肝外组织


IV 型,又称葡萄糖激酶(glucokinase) :

· 对葡萄糖具有特异性

· 主要分布在肝脏


己糖激酶与葡萄糖激酶的功能

HK 对葡萄糖亲和力高 ( Km=0.1mM),GK 对葡萄糖亲和力低 (Km=5~10mM)

HK 可被产物 G-6-P 抑制

 · 可保证细胞在血糖浓度高时糖摄取速度稳定

GK 不被 G-6-P 抑制

 · 血糖浓度高时起作用,促进肝细胞摄取葡萄糖

 · 在血糖浓度低时,肝不摄取葡萄糖

胰岛素可诱导 GK 的合成,降低血糖


2. 6-磷酸葡萄糖的异构(isomerization)

G-6-P 经磷酸己糖异构酶(phosphoglucose isomerase)催化,转变为 6-磷酸果糖 (fructose-6-phosphate, F-6-P)

反应可逆



3.  6-磷酸果糖的磷酸化

★ F-6-P 经磷酸果糖激酶 1(phosphofructokinase-1) 作用生成 1,6-二磷酸果糖(fructose-1,6-bisphosphate)

★ 糖酵解第二个消耗 ATP 的反应


4.  1,6-二磷酸果糖的裂解(cleavage)

★ 1,6-二磷酸果糖在醛缩酶(aldolase)的作用下裂解:

 · 3-磷酸甘油醛(glyceraldehyde-3-phosphate)

 · 磷酸二羟丙酮(dihydroxyacetone phosphate)

★ 裂解发生在 3 号碳与 4 号碳原子之间


5.  磷酸丙糖的互变

★ 磷酸丙糖异构酶(triose phosphate isomerase)催化磷酸二羟丙酮3-磷酸甘油醛的互变

★ 反应的能量变化有利于磷酸二羟丙酮的生成,3-磷酸甘油醛被消耗,拉动反应向右进行


6.  3-磷酸甘油醛的氧化(Oxidation)

★ 3-磷酸甘油醛脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)作用下,3-磷酸甘油醛被氧化,生成 1,3-二磷酸甘油酸(1,3-bisphosphoglycerate,1,3-BPG)

★ 氧化反应高度放能,驱动羧基与无机磷酸的结合

★ 脱去的氢由 NAD+运载,生成 NADH


氢的运载体:NAD+

★ 烟酰胺(nicotinamide/vitamin PP)可形成两种辅酶形式:

 · 辅酶 I:烟酰胺腺嘌呤二核苷酸,NAD+

 · 辅酶 II:烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸,NADP+

★ 二者均是脱氢酶的辅酶,也是氢的运载体


Nicotinamide adenine dinucleotide, NAD+



高能磷酸化合物

1,3-二磷酸甘油酸的酸酐键是高能键,水解时能量释放为 11.8 kcal/mol

高能磷酸化合物(energy-rich phosphate)


7.  3-磷酸甘油酸生成

磷酸甘油酸激酶(phosphoglycerate kinase)催化高能磷酸键的转移

二磷酸甘油酸转变为 3-磷酸甘油酸(3-phosphoglycerate),ADP 转变为 ATP

生理条件下可逆



底物水平磷酸化

底物水平磷酸化(substrate-level phosphorylation):

 · 底物将自身的高能键转给ADP(GDP)生成ATP(GTP)的过程

区别于氧化磷酸化(oxidative phosphorylation)


2,3-二磷酸甘油酸支路

红细胞存在特有的糖酵解旁路,生成 2,3-BPG

2,3-BPG 在红细胞中浓度很高

可与血红蛋白结合,调节运氧能力



8.  3-磷酸甘油酸转变为 2-磷酸甘油酸

磷酸甘油酸变位酶(phosphoglycerate mutase)作用,3-磷酸甘油酸转变为 2-磷酸甘油酸

生理条件下可逆


9.  生成磷酸烯醇式丙酮酸

烯醇化酶(enolase)作用,2-磷酸甘油酸脱水生成磷酸烯醇式丙酮酸(phosphoenolpyruvate, PEP)。

生理条件下可逆,生成高能磷酸化合物 PEP。


10.  丙酮酸与第二个 ATP 生成

PEP 经丙酮酸激酶(pyruvate kinase)作用,高能磷酸基团转移给 ADP,生成丙酮酸(pyruvate) ATP