基础生物化学

沈阳农业大学 吕淑霞

目录

  • 1 第一章 绪   论
    • 1.1 绪论 知识点1
  • 2 第二章 蛋白质化学
    • 2.1 蛋白质化学 知识点1
    • 2.2 蛋白质化学 知识点2
    • 2.3 蛋白质化学 知识点3
    • 2.4 蛋白质化学 知识点4
    • 2.5 蛋白质化学 知识点5
    • 2.6 蛋白质化学 知识点6
  • 3 第三章 核酸化学
    • 3.1 核酸化学 知识点1
    • 3.2 核酸化学 知识点2
    • 3.3 核酸化学 知识点3
    • 3.4 核酸化学 知识点4
    • 3.5 核酸化学 知识点5
  • 4 第四章 酶
    • 4.1 酶 知识点1
    • 4.2 酶 知识点2
    • 4.3 酶 知识点3
    • 4.4 酶 知识点4
    • 4.5 酶 知识点5
    • 4.6 酶 知识点6
    • 4.7 酶 知识点7
  • 5 第五章 糖类代谢
    • 5.1 糖类代谢 知识点1
    • 5.2 糖类代谢 知识点2
    • 5.3 糖类代谢 知识点3
    • 5.4 糖类代谢 知识点4
  • 6 第六章生物氧化和氧化磷酸化
    • 6.1 生物氧化和氧化磷酸化 知识点1
    • 6.2 生物氧化和氧化磷酸化 知识点2
    • 6.3 生物氧化和氧化磷酸化 知识点3
    • 6.4 生物氧化和氧化磷酸化 知识点4
  • 7 第七章 脂类代谢
    • 7.1 脂类代谢 知识点1
    • 7.2 脂类代谢 知识点2
    • 7.3 脂类代谢 知识点3
    • 7.4 脂类代谢 知识点4
    • 7.5 脂类代谢 知识点5
    • 7.6 脂类代谢 知识点6
  • 8 第八章 蛋白质降解和氨基酸代谢
    • 8.1 蛋白质降解和氨基酸代谢 知识点1
    • 8.2 蛋白质降解和氨基酸代谢 知识点2
    • 8.3 蛋白质降解和氨基酸代谢 知识点3
  • 9 第九章 核酸降解和核苷酸代谢
    • 9.1 核酸降解和核苷酸代谢 知识点1
    • 9.2 核酸降解和核苷酸代谢 知识点2
    • 9.3 核酸降解和核苷酸代谢 知识点3
  • 10 第十章 核酸的生物合成
    • 10.1 核酸的生物合成 知识点1
    • 10.2 核酸的生物合成 知识点2
    • 10.3 核酸的生物合成 知识点3
    • 10.4 核酸的生物合成 知识点4
  • 11 第十一章 蛋白质的生物合成
    • 11.1 蛋白质的生物合成 知识点1
    • 11.2 蛋白质的生物合成 知识点2
    • 11.3 蛋白质的生物合成 知识点3
  • 12 第十二章  代谢调节
    • 12.1 代谢调节 知识点1
    • 12.2 代谢调节 知识点2
核酸的生物合成 知识点2
  • 1 理论教学
  • 2 实践演练









掌握DNA损伤及其修复方法。




DNA是储存遗传信息的物质。从生物遗传角度来讲,要求在复制过程中保持遗传密码的稳定性,物种才能得以延续。哺乳动物单倍体细胞的基因组由2.9X109 bp DNA组成。动物一生中,从受精卵细胞到个体死亡,这些遗传密码要经过千万次的复制。在物种进化的长河中,DNA复制的次数更是难以计数,而且生物体内外环境都存在着使DNA损伤(DNA damage)的因素。可见,除DNA复制的高度真实性外,还要求某种修复DNA损伤的机制。

(一)造成DNA损伤的因素

造成DNA损伤的因素有生物体内自发的、亦有外界物理和化学等因素。

1自发的因素

由于DNA分子受到周围环境溶剂分子的随机热碰撞(thermal collision),腺嘌呤或鸟嘌呤与脱氧核糖间的N-糖苷键可以断裂,使AG脱落。人体细胞中DNA每天每个细胞要脱落5000个嘌呤碱,每天每个细胞也有100个胞嘧啶自发脱氨而成尿嘧啶。

2物理因素

1)紫外线损伤由于嘌呤环与嘧啶环都含有共轭双键,能吸收紫外线而引起损伤。嘧啶碱引起的损伤比嘌呤碱大10倍。损伤是由于嘧啶二聚体的产生,即2个相邻嘧啶碱的C5C6共价交联。

2)电离辐射损伤如X射线和γ射线,可以是辐射能量直接对DNA的影响,或DNA周围的溶剂分子吸收了辐射能,再对DNA产生损伤作用。如碱基的破坏、单链的断裂、双链的断裂、分子间的交联、碱基脱落或核糖的破坏等。

3化学因素

(二)DNA损伤的类型

根据DNA分子的改变,可把突变分为下面几种主要类型。

点突变

点突变(point mutation)DNA分子上一个碱基的变异,可分为:转换(transition)同型碱基,如一种嘌呤代替另一种嘌呤或一种嘧啶代替另一嘧啶。颠换(transversation)异型碱基,即嘌呤变嘧啶,或嘧啶变嘌呤。点突变可根据发生在DNA分子的部位,如发生在启动子或剪接信号部位可以影响整个基因的功能;若发生在编码序列,有的可以改变蛋白质的功能如引起镰状红细胞贫血;有的则为中性变化,即编码氨基酸虽变化,但功能不受影响;有的甚至是静止突变,碱基虽变但编码氨基酸种类不变。

缺失 

缺失(deletion)是一个碱基或一段核苷酸链乃至整个基因,从DNA大分子上丢失。如有些地中海贫血、生长激素基因缺失,再如上述Lesch- Nyhan综合征是HGPRT基因缺失。

插入

插入(insertion)是一个原来没有的碱基或一段原来没有的核苷酸序列插入到DNA大分子中去,或有些芳香族分子如吖啶(acridine)嵌入DNA双螺旋碱基对中,可以引起移码突变(frame-shift-mutation),影响三联体密码的阅读方式。

倒位

DNA链内部重组,使其一段方向颠倒。

 

(三)修复机制

光修复机制

这种机制主要存在于低等生物。

1.不需要光复活酶

光复活酶(photoreactivating enzyme)也称为DNA光修复酶(photolyase)。当280nm紫外线照射DNA产生的嘧啶二聚体,在短波239nm照射下,二聚体即分解成单体。

2.需要光复活酶紫外线照射使光复活酶激活,能解聚嘧啶二聚体。

切除修复

因不需要光照射,故也称暗修复。DNA引起大的损伤,包括UV引起的嘧啶二聚体、嘧啶/ 环丁烷二聚体、几个其它类型的碱基加合物、通过曝露于香烟的烟尘在DNA中形成的苯并芘尿嘧啶。一般由切除修复(excision repair)系统修复。该修复途径对所有生物的生存是关键的。在大肠杆菌E.coli中,有一种UV特异的切割酶(excinucleaseUVrABCenzyme),能识别UV照过产生的二聚体部位。并在远离损伤部位5′8个核苷酸处及3′4个核苷酸处各作一切口。像外科手术扩创一样,将含损伤的一段DNA切掉。DNA聚合酶进入此缝隙,从3′-OH开始,按碱基配对原则以另一条完好链为模板进行修复。最后由DNA连接酶将新合成的DNA片段与原来DNA链连接而封口。真核细胞的切割核酸酶的作用和机制,是与细菌的酶完全类似的方式对嘧啶二聚体切割。切除修复是人体细胞的重要修复形式,有些遗传性疾病如着色性干皮病(xerodermapigmentosum),是常染色体隐性遗传性疾病。纯合子患者的皮肤对阳光或紫外线极度敏感,皮肤变干、真皮萎缩、角化、眼睑结疤、角膜溃疡,易患皮肤癌。此病是由于缺乏UV特异内切核酸酶造成的。

碱基切除修复

每个细胞都有一类DNA糖苷酶(DNA glycosylase),每一种酶能识别一种DNA分子中改变的碱基,能水解该改变的碱基与脱氧核糖间的糖苷键,使改变的碱基脱落,在DNA上产生一个缺嘌呤或缺嘧啶的位(apurinic-or apyrimidinic-siteAPsite,再藉切除修复机制进行修复。现知至少有20种不同的DNA糖苷酶,各具特异性。如识别胞嘧啶脱氨生成的尿嘧啶,腺嘌呤脱氨基产物,开环的碱基,不同烷基化类型的碱基等。如胞嘧啶脱氨后即成尿嘧啶,若不纠正,可引起类型转换,即G-C→A-T

碱基切除修复(base-excision repair)步骤如下:

1)DNA糖苷酶识别损伤的碱基,在碱基和脱氧核糖之间切割。

2AP核酸内切酶切AP位置附近的磷酸二酯键。 

3DNA聚合酶用它的5′→3′外切酶活性除去损伤链,从缺口的3′-OH起始

修复合成,用新合成的DNA替代。

4)最后缺口由DNA连接酶封口



镰刀型贫血病

镰刀型贫血病是血红蛋白分子遗传缺陷造成的一种疾病,病人的大部分红细胞呈镰刀状。其特点是病人的血红蛋白β—亚基N端的第六个氨基酸残基是缬氨酸(vol),而不是下正常的谷氨酸残基(Glu)。血红蛋白是个四聚体蛋白,血红蛋白和肌红蛋白的氧合曲线不同,血红蛋白是个别构蛋白,因此镰刀型细胞贫血病是一种分子病。它是一种遗传性贫血症,属隐性遗传。是基因突变产生的血红蛋白质分子结构改变的一种分子病。患者的红细胞缺氧时变成镰刀形(正常的是圆盘形),失去输氧的功能,许多红血球还会因此而破裂造成严重贫血,甚至引起病人死亡。