基础生物化学

沈阳农业大学 吕淑霞

目录

  • 1 第一章 绪   论
    • 1.1 绪论 知识点1
  • 2 第二章 蛋白质化学
    • 2.1 蛋白质化学 知识点1
    • 2.2 蛋白质化学 知识点2
    • 2.3 蛋白质化学 知识点3
    • 2.4 蛋白质化学 知识点4
    • 2.5 蛋白质化学 知识点5
    • 2.6 蛋白质化学 知识点6
  • 3 第三章 核酸化学
    • 3.1 核酸化学 知识点1
    • 3.2 核酸化学 知识点2
    • 3.3 核酸化学 知识点3
    • 3.4 核酸化学 知识点4
    • 3.5 核酸化学 知识点5
  • 4 第四章 酶
    • 4.1 酶 知识点1
    • 4.2 酶 知识点2
    • 4.3 酶 知识点3
    • 4.4 酶 知识点4
    • 4.5 酶 知识点5
    • 4.6 酶 知识点6
    • 4.7 酶 知识点7
  • 5 第五章 糖类代谢
    • 5.1 糖类代谢 知识点1
    • 5.2 糖类代谢 知识点2
    • 5.3 糖类代谢 知识点3
    • 5.4 糖类代谢 知识点4
  • 6 第六章生物氧化和氧化磷酸化
    • 6.1 生物氧化和氧化磷酸化 知识点1
    • 6.2 生物氧化和氧化磷酸化 知识点2
    • 6.3 生物氧化和氧化磷酸化 知识点3
    • 6.4 生物氧化和氧化磷酸化 知识点4
  • 7 第七章 脂类代谢
    • 7.1 脂类代谢 知识点1
    • 7.2 脂类代谢 知识点2
    • 7.3 脂类代谢 知识点3
    • 7.4 脂类代谢 知识点4
    • 7.5 脂类代谢 知识点5
    • 7.6 脂类代谢 知识点6
  • 8 第八章 蛋白质降解和氨基酸代谢
    • 8.1 蛋白质降解和氨基酸代谢 知识点1
    • 8.2 蛋白质降解和氨基酸代谢 知识点2
    • 8.3 蛋白质降解和氨基酸代谢 知识点3
  • 9 第九章 核酸降解和核苷酸代谢
    • 9.1 核酸降解和核苷酸代谢 知识点1
    • 9.2 核酸降解和核苷酸代谢 知识点2
    • 9.3 核酸降解和核苷酸代谢 知识点3
  • 10 第十章 核酸的生物合成
    • 10.1 核酸的生物合成 知识点1
    • 10.2 核酸的生物合成 知识点2
    • 10.3 核酸的生物合成 知识点3
    • 10.4 核酸的生物合成 知识点4
  • 11 第十一章 蛋白质的生物合成
    • 11.1 蛋白质的生物合成 知识点1
    • 11.2 蛋白质的生物合成 知识点2
    • 11.3 蛋白质的生物合成 知识点3
  • 12 第十二章  代谢调节
    • 12.1 代谢调节 知识点1
    • 12.2 代谢调节 知识点2
核酸的生物合成 知识点4
  • 1 理论教学
  • 2 实践演练









掌握转录后加工。




原核生物mRNA的转录产物,一般无需加工已具有活性,即可作为翻译的模板,近年也发现需要添加3’polyA的现象。而对rRNAtRNA转录产物的加工、修饰了解比较多,分别叙述如下:

rRNA的加工

tRNA的加工

1RNAIII:

2RNAD:

3RNAP:

4tRNA核苷酸转移酶tRNA没有3’端的CCAItRNA3’CCA亦有被核酸酶降解的可能性。此酶以ATPCTP为原料催化tRNA3’CCA的形成。

 一、真核生物RNA转录后的加工

rRNA转录后的加工

真核生物的rRNA5S5.8S18S28S四种,其中5.8S18S28S是由RNA聚合酶I催化一个转录单位,产生45SrRNA前体,rRNA转录后加工包括前体rRNA与蛋白质结合,然后再切割和甲基化。

在研究rRNA转录加工的过程中,发现某些真核生物如四膜虫(Trtrahymena)的26S

rRNA的前体为6.4kb,含有414核苷酸的内含子,可以在完全没有蛋白质的条件下,自身剪接,能很准确地将414核苷酸内含子剪除,而使两个外显子相连接为成熟的26SRNA。这种具有催化功能的RNA称为核酶(ribozyme),意为可切割特异性RNA序列的RNA分子。核酶的二级结构有多种,其中一种呈槌头状(hammerhead)结构,含有若干茎(stems)和环(loops)。例如烟草环斑(rinsport)病毒的卫星RNA的自身剪接序列具有槌头状结构。

根据核酶的槌头状结构,通过人工设计合成,可使原来没有核酶活性的RNA,成为具有核酶活性的RNA,用于阻断病源生物或肿瘤基因的表达,为对感染性疾病及肿瘤的治疗提供了新的思路。如图13-12所示,下半部的24核苷酸链,是没有核酶活性的病原体或肿瘤的RNA,,根据槌头状结构原理,人工设计合成上半部的19核苷酸链,与其配成槌头状结构,使下半部分成为人工核酶的特异切割部位,阻断其表达,达到防治某些疾病的目的。例如,现已在探索用核酶来破坏人免疫缺陷病毒(HIV)的临床治疗方案。

tRNA转录后的加工

tRNA的加工包括切除和碱基修饰,有些则需剪接。

tRNA的碱基约有10%需要酶促修饰,修饰有如下类型:tRNA3’端的UCCA取代;嘌呤碱或核糖C2’的甲基化;尿苷被还原成双氢尿苷(DH)或核苷内的转位反应,成为假尿嘧啶核苷();某些腺苷酸脱氨成为次黄嘌呤核苷酸(AMP→IMP)。

mRNA转录后的加工

真核生物mRNARNA聚合酶II催化转录,初始产物为核不均一RNAheterogeneousnuclear RNAhnRNA),新生的hnRNA从开始形成到转录终止,就逐步与蛋白质结合形成不均一核糖核蛋白(hnRNP)颗粒,前mRNA加工的顺序是形成5’帽子结构;内切酶去除3’端的一段序列;polyA聚合酶催化形成3’polyA尾;最后是剪接去除内含子转变为成熟的mRNA

15’帽的形成:hnRNA 5’端的第一个核苷酸通常为三磷酸鸟苷(5’-pppGpN-),在磷酸酶催化下去除γ-磷酸基团形成5’-ppGpN···,经鸟苷酰转移酶催化与另一个GTPpppG)作用生成GpppGpN···,在鸟嘌呤-7-甲基转移酶作用下,以S-腺苷蛋氨酸为甲基来源,生成m7GpppGpN···,再经2’甲基转移酶催化,使5’端原来的第一位,甚至第二位核苷酸的2’-O位甲基化,形成m7GpppGmN···,或m7GpppGpmNm···

可见5’帽结构有三种形式;m7GpppGpN···为帽0m7GpppGmpN···为帽1m7GpppGmpNm···为帽2。不同真核生物的mRNA或同一生物的不同mRNA有不同的5’帽结构。

2.前mRNA 3’端切除及加poly A尾:除组蛋白的mRNA外,真核生物的所有mRNA都有3’polyA尾。研究表明,由于结构基因中编码链的3’端没有polyA序列,mRNApolyA尾是转录后加工形成的,其过程是:加polyA位点上游1035核苷酸处有AAUAAA序列,下游约50核苷酸处有富含GU序列,这两处序列是剪切和加polyA所需的信号。首先由剪切和聚腺苷化特异因子(cleavageand polyadenylation specific factorCPSF)结合到上游富AAUAAA序列,剪除刺激因子(cleavagestimulation factorCSF)与下游富含GU序列作用,剪除因子cleavagefactorCF)相继与之结合,使其更趋稳定。在剪除之前,polyA聚合酶结合到复合物上,使剪切后游离的3’端能迅速腺苷酸化。polyA的生成分二个阶段,如图13-14

3mRNA的剪接:真核生物编码mRNA的基因是断裂基因,有外显子和内含子并共同转录于初始转录产物中,须将转录产物中的内含子去除,并把外显子连接为成熟的mRNA分子,这个过程称为剪接(splicing),剪接位点在外显子的3’端与内含子的5’端连接点及内含子3’端与下一个外显子5’端连接点。为便于叙述,把位于内含子5’端的剪切点称为5’端剪接点,位于内含子3’端的剪切点称为3’端剪接点。



丙酮酸激酶的可变剪接

丙酮酸激酶M1 型和 M2型本是同一条基因,在 alternative splicing(可变剪接)的作用下分别表达为两种不同的蛋白。其中 M1型存在于肌肉细胞中,活性很正常很稳定;但 M2型则存在于癌细胞中,易受调节而失活,从而造成细胞代谢紊乱 (Mazurek, S. 2011 Int. J.Biochem. Cell Biol. 43, 969-980