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1 理论教学
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2 实践演练

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了解RNA的结构与类别;掌握参与蛋白合成的RNA结构特征及其功能,熟悉具有其他功能的RNA;明确DNA与RNA的结构差异。
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一、核酸的一般物理性质
1.溶解性
DNA和RNA在细胞内常以核蛋白形式存在,DNA核蛋白可溶于高浓度(1~2mol/L)的NaCl溶液,而RNA核蛋白则易溶于0.14mol/L的NaCl溶液,因此,可用不同浓度的盐溶液分离两种核蛋白。
DNA为白色纤维状固体,RNA为白色粉末状固体,核酸微溶于水,其钠盐在水中的溶解度较大。但不溶于乙醇、乙醚、氯仿;当乙醇浓度达50%时,DNA就沉淀出来,当乙醇浓度达75%时RNA也沉淀出来。
2.分子大小
DNA分子极大,分子量在106以上,RNA的分子比DNA分子小得多。核酸分子的大小可用长度、核苷酸对(或碱基对-bp)数目、沉降系数(S)和分子量等表示。
3.形状及粘度
线性DNA为细长分子,直径与长度之比可达1:107,即使很稀DNA溶液,粘度很大。 RNA溶液的粘度要小得多。变性的或降解的核酸溶液粘度下降。
二、核酸的紫外吸收特性
嘌呤碱和嘧啶碱具有共轭双键,使碱基、核苷、核苷酸和核酸在260nm处有最大的紫外吸收特性。这一特性的实践应用:
(1)定量测定核酸的理论基础——λmax=260nm
(2)核酸纯度鉴定:通常纯品DNA,其OD260/OD280=1.8;纯品RNA,其OD260/OD280 =2.0
(3)核酸含量测定:当OD260=1,双链DNA含量相当于50μg/mL、单链DNA/RNA含量相当于40μg /mL、核苷酸含量相当于20μg /mL。
(4)核酸状态的判断:当DNA溶液OD260增加,可能产生变性或降解作用。
三、核酸的两性解离性质
1.两性解离
(1)两性离子:核酸分子的酸性解离和碱性解离程度相等,所带的正电荷与负电荷相等粒子称为两性离子。
(2)等电点:以两性离子形式存在在、净电荷为零时的核酸溶液的pH。
(3)在等电点时,核酸溶液的溶解度最小。因此,可以进行沉淀以分离核酸。
(4)核酸在远离等电点偏碱性的溶液中带负电。因此,电泳时在电场中向阳极移动。
2.电泳
(1)电泳的概念:带负电的核酸,在电场中向阳极移动的现象。
(2)电泳的原理:两个效应——电荷效应、分子筛效应。
(3)影响电泳的因素:粒子的带电性质、带电多少,分子大小、分子形状; 介质pH、离子强度,凝胶浓度、电场强度。
(4)电泳应用:分离、鉴定、纯化核酸;核酸分子量测定等。
四、核酸的变性与复性及分子杂交
1.DNA的变性
双链dsDNA间氢键断裂→单链ssDNA,不涉及共价键断裂。变性实质是氢键打开,一级结构不变。变性的核酸链内部碱基暴露出来,产生紫外吸收值增加现象,即增色效应。
核酸变性因素有物理的或化学的:包括加热、极端的pH、有机溶剂、尿素等。
DNA热变性时,双螺旋结构失去一半时的温度称该DNA的熔点或熔解温度(melting temperature),用Tm值表示。DNA的G-C含量高则Tm值高。
伴随变性DNA的理化性质改变:失去生物活性;粘度降低,浮力密度升高,紫外吸收增加(增色效应)。
2. DNA的复性
变性DNA在适当的条件下,彼此分开的两条链又重新缔合为双螺旋的过程。热变性的DNA经缓慢冷却后可复性,这一过程称为退火。复性产生减色效应。
3. 核酸分子杂交
核酸分子杂交基本原理是核酸的变性与复性。两条来源不同、但有互补关系的DNA单链,或DNA单链与RNA分子,在去掉变性条件后互补的区段能够退火形成双链DNA分子或DNA/RNA异质双链的过程称为分子杂交(hybridization)。
核酸分子杂交应用:研究DNA分子中某一种基因的位置;确定两种核酸分子间的序列相似性;检测某些专一序列在待检样品中存在与否;分子杂交也是基因芯片技术的基础。
五、核酸的沉降特性
生物大分子在单位离心力场作用下的沉降速度称为沉降系数。即沉降系数是微颗粒在离心力场的作用下,从静止状态到达极限速度所需要的时间。其单位用Svedberg,即S表示,S=1×10-13秒。生物体核酸、蛋白质等生物大分子物质可以用S表示其分子大小。
六、核酸的降解
核酸的降解分为酸解、碱解及酶解。温和的酸条件,核酸不降解;但长时间、高温及强酸核酸则会水解。
RNA分子在碱性条件下,发生碱解产生2′-核苷酸和3′-核苷酸的混合物;而DNA因为其戊糖的2′位是脱氧的,因此,DNA不能被碱解(稳定)。可以利用些特性进行RNA与DNA的区分。
降解核酸的酶分为:核酸外切酶(5′-外切酶,3′-外切酶);核酸内切酶。
七、核酸的常用研究方法
核酸的研究中常用的方法有很多。如离心沉降技术、紫外分光光度法(λmax=260nm)、电泳技术、分子杂交技术、聚合酶链式反应(PCR)、序列测定技术、基因芯片技术等。
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限制内切酶
核酸内切酶(Restrictionendonuclease, RE)是识别特定DNA序列、并在识别点或其周围切割双链DNA的一类核酸内切酶。按RE的组成、与修饰酶活性关系、切割核酸的情况不同,RE分为三类:Ⅰ类RE与Ⅲ类RE除具有内切酶活性外、还具有修饰酶活性,分子生物学应用最广的是Ⅱ类RE。根据切割位点相对于对称轴的位置不同,RE有三种切割方式:在对称轴5′-侧切割产生5′-粘端;在对称轴3′-侧切割产生3′-粘端;在对称轴处切割产生平齐端。RE在识别和进行切割时,对DNA的识别没有种属特异,因此,限制内切酶在重组DNA的分子操作中具有重要作用,是一把天赐“神刀”。
含某种RE的细胞,要么基因组DNA中不含有该种酶的识别序列,要么通过甲基化酶将甲基转移到识别序列的碱基上,从而起到保护作用免受RE的切割。这也是细菌通过对自己DNA上的识别序列进行甲基化修饰来保护自己的DNA不被RE破坏的机制——即细菌细胞的限制-修饰系统。
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