1．马牛羊传染病
我国在马牛羊传染病的防制和研究工作中，以消灭牛瘟、牛肺疫和控制马传染牲贫血所取得的成就最为突出。建国前牛瘟流行几乎遍及全国。建国初期十几个省区的牛瘟疫情仍然十分严重，党和政府极为重视牛瘟的防制工作，全国推广应用我国陈凌风、袁庆志等研制的牛瘟兔化弱毒、牛瘟山羊化兔化弱毒和牛瘟绵羊化兔化弱毒疫苗，积极开展扑灭牛瘟的工作，到1956年全国已不再有牛瘟发生。自1949年算起，只用了6年的时间，在幅员辽阔、交通不便、养牛7000万头以上的国家彻底消灭了牛瘟，其速度之快是世界各国所少见的，这为我国近代兽医史写上了光辉的一页。
牛肺疫曾使我国养牛业遭受很大损失。吴庭训等1958年研制成牛肺疫兔化弱毒菌苗，1959年又研制成牛肺疫兔化绵羊适应菌苗，经广泛应用并结合封锁、消毒等措施，使我国于1996年宣告彻底消灭牛肺疫，这是我国家畜疫病防制工作的又一个重要里程碑。
早在20世纪30年代，马传染性贫血传入我国，在广大农村引起暴发流行，造成大批马匹死亡，对我国养马业危害极其严重。我国从1974年开始将临诊综合诊断、补体结合试验和琼脂扩散试验3种方法列入诊断该病的规程，80年代以后，相继研究建立了更加敏感、检出率更高的荧光抗体、ELISA和单克隆抗体技术。沈荣显等人于1967年开始将马传贫强毒用驴白细胞连续培养，经过长期继代后，改变了病毒的生物学特性，最后培育成一株毒力弱、免疫原性良好、可以用以制造疫苗的驴白细胞弱毒株。用弱毒的驴白细胞培养物或驴胎二倍体细胞培养物制成的马传贫弱毒疫苗，对马、驴接种后免疫力的产生虽较缓慢，但免疫持续期较长，免疫保护率较高。这是目前国际上唯一的马传染性贫血活毒疫苗，该成果达到国际先进水平。
此外，我国在布氏杆菌病、牛流行热、羊痘、牛黏膜病、牛白血病、蓝舌病等疫病的免疫预防和诊断技术等方面的研究也都取得了卓越的成果。布氏杆菌羊种5号菌苗、猪种2号菌苗、羊痘鸡胚化弱毒疫苗、牛流行热灭活疫苗和亚单位疫苗以及蓝舌病鸡胚化弱毒疫苗和羟胺灭活疫苗的研制成功及其推广应用，为控制这些传染病作出了重要贡献。特别是近年来在兽医生物技术研究方面，开展单克隆抗体、核酸探针和PCR诊断技术研究，建立了马传染性贫血、口蹄疫、禽流感、猪繁殖与呼吸综合征、圆环病毒病、鸡的J型白血病、布氏杆菌病、牛白血病、牛黏膜病和牛鼻气管炎等病的分子诊断技术，并应用于科学研究和生产实践中，取得了可喜的成果。
目前我国的马属动物渐趋减少，而且随着国家产业政策的调整，特别是随着大力提倡发展草食家畜政策的实施，牛羊尤其是奶牛和肉牛养殖业将会有一个大的发展，因此牛羊传染病的研究将是未来我国动物传染病研究的一个新热点和重要领域。
2．猪传染病
我国是世界上养猪最多的国家，历来十分重视猪病的防制和研究。在猪病中，猪瘟是危害最大、最受重视的一种疫病。建国初期，何正礼、方时杰等选用抗原性优良的石门系毒株研究改进制成的猪瘟结晶紫疫苗效果明显，广泛应用后对控制当时猪瘟的流行曾起过很大的作用。1955-1956年我国周泰冲等研制成功的中国系猪瘟兔化弱毒疫苗，有高度安全性和优良的免疫原性，且无残毒，毒力不返强，自1957年起，除在我国广泛应用外，并己推广到欧亚很多国家，使这些国家控制或消灭了猪瘟。该疫苗被公认为目前世界上比较理想的猪瘟疫苗，这是我国兽医工作者的一大杰出贡献。近年来猪瘟流行和发病特点己发生很大变化，出现了以母猪繁殖障碍和仔猪先天性感染为特征的非典型猪瘟，我国很多地区都有这类病例报道。经“973”等国家重大科研项目研究证明：中国系猪瘟兔化弱毒疫苗仍然是防制本病最有效的疫苗，防制本病的有效措施是应用高质量的疫苗，采用合理的免疫程序，加强饲养管理，辅以血清学监测技术，对持续感染猪和强毒感染猪实施淘汰的办法。近年来在猪瘟疫苗生产方法的改进、免疫程序、免疫诊断、免疫监测以及非典型猪瘟等方面的研究都取得了显著成果。
我国对猪丹毒、猪气喘病等也曾组织各地兽医力量进行深入研究，协作攻关，研制出安全有效的猪丹毒GC42和G4T10弱毒菌苗和灭活苗、猪病三联(猪瘟、丹毒、肺疫)和二联(猪瘟、丹毒)疫苗，同时研制成国内外首创的猪气喘病弱毒菌苗，并提出了有效的防制措施。
由于现代养猪业生产规模和饲养密度加大，致使猪呼吸系统传染病的发生越来越频繁，病因也越来越复杂。在国际上公认的危害现代养猪业的重大疾病中，呼吸系统传染病就占3种，即猪传染性胸膜肺炎、猪萎缩性鼻炎和猪支原体性肺炎(猪气喘病)，这些病在我国均已普遍存在且已造成严重危害。由于政府及时组织力量开展广泛研究，目前对这几种病均已研制出安全有效的疫苗和快速简便的诊断方法。实践证明免疫预防是解决呼吸系统传染病的有效措施，而猪呼吸道病多联疫苗的开发则是今后的研究方向。
猪传染性繁殖障碍综合征的病因较多，国际己公认的有非典型猪瘟、伪狂犬病、猪细小病毒病、流行性乙型脑炎、猪衣原体病以及近年来新发现的猪繁殖与呼吸综合征、猪脑心肌炎、猪圆环病毒等。目前我国己相继研究成功了伪狂犬病、猪细小病毒病、流行性乙型脑炎和猪衣原体病的有效检测方法和以疫苗接种为主要手段的防制措施。在伪狂犬病基因工程疫苗研究方面，郭万柱教授研制的伪狂犬病基因缺失疫苗已获国家新兽药证书。猪繁殖与呼吸综合征、圆环病毒病己在我国发生并已广泛传播，目前国家正在组织调查研究并采取积极的防制措施，必将很快使其得到有效控制。
猪传染性腹泻是引起严重经济损失的一大类疫病，包括大肠杆菌病、仔猪副伤寒、传染性胃肠炎、流行性腹泻和猪痢疾等。我国兽医科学工作者在病原特性、诊断方法和免疫预防等方面都已做了大量研究，取得显著成果。传染性胃肠炎、流行性腹泻和轮状病毒的疫苗及其联苗己研制成功，能同时检测这三种腹泻性病毒的ELISA试剂盒业已问世。大肠杆菌K88、K99、987P三价灭活苗已推广应用。近年来，表达K88-LTB两种抗原的双价基因工程菌苗己投入批量生产(简称MM活菌苗)，这是我国第一个获批准的兽用基因工程菌苗；仔猪副伤寒-大肠杆菌腹泻双价基因工程菌株已构建成功，制苗试用后可产生较高水平的抗体反应。此外，近年来我国在微生态制剂的研究和应用方面己取得显著成果。应用微生态制剂(非致病性活菌制剂)防治仔猪黄、白痢也显示良好的前景。这些制剂使用方便、安全、价廉、无副作用、疗效高，还有提高仔猪增重等效果。
进入21世纪以来，随着我国新一轮养猪高潮的兴起，猪传染病的流行日渐凸出，其危害和重要性越来越引起人们重视。因此猪传染病的研究目前正处于兴盛时期，无论是在研究规模、研究手段还是在研究成果上都已接近或赶上国际水平。但在实际应用上仍与发达国家有一定差距，所以在近些年内猪的传染病仍是我国传染病防制工作的重点研究内容之一。
3．家禽传染病
家禽传染病严重制约着养禽业的发展，因此我国政府历来高度重视此类疾病的防制和研究工作，并取得了巨大成绩。例如新城疫在我国是分布最广、危害最严重的禽病之一，早在1935年即有该病流行的报道。国家每年投入大量经费对本病开展深入系统的防制研究，尤其在疫苗研制、免疫程序、免疫方法和免疫监测等方面取得突出成就，有效控制了该病的流行。特别是最近的研究结果已经证明，虽然新城疫病毒出现了九个基因型，并能在鹅和其它禽类中暴发流行，但现有弱毒疫苗和灭活疫苗是完全有效的。又如1956-l963年方定一等首次发现小鹅瘟并进行了系统研究，研制成疫苗和抗血清，对控制该病的流行作出卓越贡献，这是由我国科学家在国际上首先发现的家禽传染病。
20世纪80年代以来，随着养禽业的高速发展，我国的禽病防制和研究工作也与时俱进，步入快速发展的道路，每年公开发表的禽病研究论文常在200篇以上，禽病研究的规模和水平都已在兽医科学中跃居首位，禽病研究的领域涉及到在我国出现的所有家禽传染病。除了对一些原有禽病进行深入系统的研究外，还及时对一些新发现的传染病进行了比较广泛、系统的研究，为这些禽病的诊断检测、预防和控制提出有效的方法和措施。1992年我国华南地区鸡群中有禽流感发生，分离到中等致病力毒株H9N3，1994年向世界公布了这一事实。1997年我国香港从鸡群中分离到高致病力禽流感毒株H5N1，引起严重经济损失。哈尔滨兽医研究所研究建立了禽流感琼脂免疫扩散试验、酶联免疫吸附试验(ELISA)和斑点ELISA诊断技术，并分别组装成诊断试剂盒，又建立了直接从鸡粪便中检出H7亚型病毒的反转录一聚合酶链反应(RT-PCR)诊断法，可实现快速检测。用低致病力H5N2亚型毒株制备的灭活疫苗己推广应用，效果良好。近年来研制成的鸡马立克氏病弱毒疫苗、鸡马立克氏病毒三价苗，鸡传染性法氏囊病细胞疫苗、鸡传染性喉气管炎弱毒疫苗、鸡传染性支气管炎灭活疫苗、鸡传染性鼻炎灭活疫苗和鸭瘟弱毒疫苗等，特别是禽流感病毒H9和H5灭活疫苗以及建立的各种诊断技术在生产实践中广泛应用，对有效防制这些疫病起到重要作用。对新城疫、传染性法氏囊病、马立克氏病、传染性支气管炎、传染性喉气管炎、禽流感和产蛋下降综合征等主要禽病病原的研究已深入到分子生物学领域，包括病毒基因的分离鉴定、克隆和表达、基因表达产物的生物学功能研究、核酶剪切RNA病毒以及单克隆抗体、核酸探针、PCR、酶切图谱分析和核酸序列测定等技术的建立和应用。在新城疫病毒、马立克氏病病毒、传染性法氏囊病病毒和传染性支气管炎病毒的遗传变异和分子流行病学研究方面己取得较高水平的研究成果。
4．小动物传染病
在犬、猫、兔等小动物传染病研究方面，比较突出的是兔病毒性出血症和狂犬病。兔病毒性出血症是1984年由我国首先发现的一种病毒性急性传染病，80年代后期，该病在很多国家广泛流行，对养兔业造成灾害性损失，引起国际兽医界的重视。我国对此病进行了系统的研究，并研制成安全有效的疫苗，基本上控制了该病的流行。我国对该病的研究居国际先进水平，1990年曾在我国召开该病的国际学术研讨会。狂犬病是一种危害极其严重的人兽共患病，我国对该病的防制进行了大量工作，已基本控制其传播。解放军军事医学研究院兽医研究所的研究人员应用空斑纯化等技术，选育了对犬安全、口服效果良好的狂犬病弱毒疫苗株SRV9，口服免疫简便易行，可为控制家犬及野生动物的狂犬病提供有效的手段。他们还对不同地区、不同宿主分离的狂犬病毒G基因的主要功能区进行RT-PCR扩增和克隆，为研制适合我国的基因工程疫苗提供了科学依据。该所夏咸柱院士研制的犬六联苗已获国家新兽药证书。
5．完善了动物防疫法规
动物防疫法规是做好家畜传染病防制工作的法律依据。经济发达国家都十分重视此类法规的制定和实施。1985年国务院颁发的《家畜家禽防疫条例》和1991年全国人民代表大会常务委员会通过并予公布的《中华人民共和国进出境动植物检疫法》将我国的家畜传染病防治工作推上了法制轨道。1997年经全国人大常委会通过的《中华人民共和国动物防疫法》已于1998年1月起正式实施，其配套的实施细则也已出台。特别是我国进入WTO以来，先后经历了2003年的“非典”和2004年的禽流感，国家及时颁布了一大批疫病防治方面的法律法规，其中包括于2004年８月28日公布、自2004年12月１日起施行的《中华人民共和国传染病防治法》。这些法律法规是我国开展家畜传染病防治和研究工作的有效依据，将使我国建立、健全符合市场经济要求、能与国际接轨的兽医行政法规体系：体现预防为主、从严管理的动物防疫方针，促进养殖业生产；保证动物源性食品安全，保护人体健康；增强畜产品国际竞争力，扩大出口贸易。认真贯彻实施这些法律法规将能有效地提高我国防疫灭病工作的水平。
6.建立了生物安全保障体系
生物安全（Biosecurity或Bio-safety）目前主要涉及养殖生产中的疫病防控体系、实验室安全体系和基因工程领域3个方面。
养殖生产中疫病防控方面的生物安全（Biosecurity）主要是采取必要的有效措施，最大限度地消除各种理化和生物性致病因子对人畜的危害，是动物生产中的一种安全保障体系。它涉及诸多方面，包括养殖场的设计与控制、人员和物品流动的控制、无规定疫病区的建立和疫病控制等。其中疫病控制又包括对动物的控制、环境控制和病原体控制。我国政府2002年开始投巨资实施的无规定动物疫病区的建立为动物疫病防治工作提供了一种有效的生物安全保障，这是我国加入WTO后畜牧业与国际接轨的重要一步。无规定动物疫病区是指在规定期限内，没有发生过某种或几种疫病、同时在该区域及其边界和外围一定范围内，对动物和动物产品、动物源性饲料、动物遗传材料、动物病料、兽药（包括生物制品）的流通实施官方有效控制并获得国家认可的特定地域。无规定疫病区包括非免疫无规定疫病区和免疫无规定疫病区。无规定动物疫病区除没有特定的疫病发生这一必要条件外，还须具有以下特点：一是地区界限应由有效的天然屏障或法律边界清楚划定；二是区域内要具有完善的动物疫病控制体系、动物防疫监督体系、动物疫情监测报告体系、动物防疫屏障体系以及保证这些体系正常运转的法律、行政制度和技术、资金支持；三是宣布无疫病必须要有令人信服、严密有效的疫病监测证据支持；四是除非实施严格的进口条件，无规定动物疫病区不能从感染地区或国家进口可能引入疫病的畜禽及其产品。国家计划先建设无规定动物疫病区示范区，包括山东、辽宁、四川、重庆、吉林、海南６省市的117个县、2758个乡镇。到2003年底项目区已建成完备的动物疫病控制体系、动物防疫监督体系、动物疫情监测体系及动物防疫屏障体系。区域内的疫病防治、检疫、监督、疫病监测手段和水平将达到国家规定标准，并基本达到世界动物卫生组织规定标准及有关规则，在全国率先建成免疫无口蹄疫、无鸡新城疫、无猪瘟等无特定疫病区，非免疫无禽流感的无疫病区。对其中防疫体系和基础设施建设达到要求并真正实现疫病控制目标的区域，统一向国内外公布，并争取得到国际间的认可。
实验室方面的生物安全（Bio-safety）主要是指在实验室进行各种工作时，防止病原体对人畜及环境造成危害而进行的物理防护。根据实验室对病原体进行安全防护的能力，通常把其分为四级，构成4个级别的生物安全。其中很重要的一个方面就是P3实验室建设。改革开放以来，我国不但组建了兽医国家重点实验室，还建设了一大批兽医P3实验室，从而大大完善和巩固了生物安全体系。
基因工程领域的生物安全（Bio-safety）是指对由现代生物技术的开发和应用可能产生的负面影响所采取的有效预防和控制措施，目的是保护生物多样性、生态环境和人畜健康，例如对基因工程疫苗和转基因生物的严格控制等。
生物安全是目前最经济、最有效的疫病控制措施，是预防一切疫病的前提。它把疫病的综合防治作为一项系统工程来对待，在空间上重视整个生产、生态系统中各部分的有机联系，在时间上强调把各种综合防治措施贯穿于整个养殖生产的全过程，注意了不同生产环节之间的联系及其对动物的影响，确保动物始终处于最佳生产状态，最大限度地减少疫病发生的机会，从而取得最大的经济效益。
7.兽药事业发展迅速
做为为畜牧业乃至整个养殖业服务和保障的兽药行业，随着畜牧业的迅猛发展也得到了长足的进步。特别是改革开放以来经过二十多年的发展，我国兽药行业已成为一个相对独立、并具有强大生命力的产业。据统计，我国现有兽药生产企业2600余家，生产的兽药品种规格约有2000多种，年产值已超过150亿元人民币；全国约有经营企业5万多家，年销售额约170亿元人民币，中国已成为继美国之后的第二大动物保健市场大国。自1987年到2002年底，农业部共批准新兽药187种，批准新生物制品134种。在这187种新兽药中，抗生素类占24％，驱寄生虫药占25％，药物添加剂及促生长剂占2％，抗菌药占25％，抗球虫药7％，消毒剂占6％， 其它的占11％。在批准的134种新生物制品中， 家禽用疫苗占27％，猪用疫苗占10％，共患病疫苗占8%，诊断液占33%，牛羊疫苗占7%，其它的占15%。
